Las declaraciones de Francisco Eguiguren sobre el caso de Chavín de Huántar han generado duras críticas por parte de políticos del país. El titular del Ministerio de Justicia, Gustavo Adrianzén, discrepó con lo manifestado por Eguiguren, y mostró su optimismo en que la sentencia de la Corte-IDH sea favorable al Estado peruano. Asimismo, indicó que “el señor Eguiguren, si bien fue propuesto por el Estado peruano en su calidad de comisionado, no representa a ningún Estado, y lo hace a título personal".
Caso Chavín de Huántar: ministro de Justicia discrepa con Francisco Eguiguren
Francisco Eguiguren consideró que el Perú perdería el litigio por el Caso Chavín de Huántar en la Corte-IDH